يضم القسم 3 مختبرات تعليمية بالاضافة الى ذالك يوجد عدة مختبرات بحثية وهي :

1. مختبر أمراض النبات التدريسي.
2. مختبر أمراض النبات الفيروسية.
3. مختبر أمراض النبات النيماتودية.
4. مختبر أبحاث الميكروبولوجيا(أمراض النبات الفطرية والبكتيرية).
5. مختبر أبحاث امراض النخيل.
6. مختبر أبحاث الفطريات( المكافحة الحيوية).
7. مختبر علوم الحشرات التدريسي.
8. مختبر أبحاث الحشرات.
9. مختبر أبحاث الهستولوجي.
10. مختبر أبحاث سلوكيات  الحشرات.
11. مختبر تربية الحشرات.
12. مختبر أبحاث الحشرات الطبية والبيطرية
13. مختبر المبيدات التدريسي.
14. مختبر أبحاث المبيدات.
15. مختبر أبحاث السموم والتلوث.

يضم القسم عدد من وحدات المساعدة في البحث والتدريس وهي :

1. وحدة ابحاث النحل.
2. وحدة الحشرات الناقلة لأمراض لانسان والحيوان.